O futebol chegou à cidade de Sertãozinho no final do século 19, trazido por ingleses que, à época, construíam a Estrada de Ferro Mogiana. Os primeiros jogos eram realizados no Largo São Sebastião, onde ocorriam disputas entre clubes amadores como União, XV de Novembro, Sertanezino, Operário, Mogiana, Palestra Itália, Sete de Setembro, Jahú, Guarani e Aliança Liberal.
Mas o Sertãozinho Futebol Clube só seria fundado na década de 40, exatamente no dia 6 de agosto de 1944. A decisão surgiu após uma reunião entre esportistas da cidade, carentes de um clube que os representasse à altura nos cada vez mais disputados campeonatos da Liga Ribeirãopretana de Futebol.
Em 1954, dez anos após a fundação do clube, veio o primeiro título, quando o time dividiu a taça de campeão amador da Liga Ribeirãopretana com a equipe do Cajuru, da cidade de mesmo nome. Em 1956, o clube conquistou o Torneio Cinquentenário de Sertãozinho.
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